Klinik Bilimler Bölümü altında faaliyet gösteren Cerrahi Anabilim Dalı, cerrahi müdahale gerektiren hastalık ve yaralanmaların tanı, tedavi ve önlenmesine yönelik eğitim ve araştırma faaliyetleri yürütmektedir. Cerrahi uygulamaların geçmişi çok eski dönemlere dayansa da modern veteriner cerrahisi özellikle 20. yüzyılın ortalarından itibaren hızlı bir gelişim sürecine girmiştir. Anestezi tekniklerinin ilerlemesi, gelişmiş görüntüleme sistemlerinin cerrahiye entegre edilmesi ve cerrahi cihaz teknolojilerindeki yenilikler, cerrahi uygulamaların etkinliğini ve güvenliğini önemli ölçüde artırmıştır.

Anabilim Dalında bir profesör, bir doçent ve bir araştırma görevlisi olmak üzere üç öğretim elemanı görev yapmaktadır. Uygulamalı eğitim faaliyetleri için bir adet klinik uygulama ve araştırma ünitesi bulunmaktadır.

Anabilim Dalı tarafından verilen zorunlu dersler arasında Dış Hastalıklara Giriş, Cerrahi I, Cerrahi II, Cerrahi III, Anesteziyoloji ve Reanimasyon, Travmatoloji ve Ortopedik Cerrahi ile Ayak Hastalıkları bulunmaktadır. Eğitim programı kapsamında Klinik Bilimler Bölümü tarafından yürütülen ortak dersler; Klinik Giriş, Klinik Uygulama Metotları I, Klinik Uygulama Metotları II ve Klinik Uygulama Metotları III şeklindedir. Ayrıca İlk Yardım, Acil Klinik Hekimliği ve Göz Hastalıkları seçmeli ders olarak sunulmaktadır.

Anabilim Dalının temel araştırma alanları; yumuşak doku cerrahisi, ortopedik cerrahi, göz hastalıkları, radyoloji ve görüntüleme teknikleri, anesteziyoloji ve reanimasyon, ayak hastalıkları, nöroşirurji, onkolojik cerrahi ve minimal invaziv cerrahi üzerinedir.